Bedarfs- und Machbarkeitsanalyse zur Einrichtung einer Core-Unit „Biomedizinische Datenanalyse“
Kontakt: M.Sc., M.Sc. Jan Christoph | jan.christoph@fau.de | 0179/9498865
Vergabe einer Masterarbeit (MPM)
2018-04-17_Masterarbeit-Ausschreibung_MPM_CoreUnit_biomedizinischeDatenanalyse
Hintergrund / Problemstellung:
Aufgrund verschiedener Erfahrungen scheint es uns, dass einige Forscher am Universitätsklinikum / medizinischen Fakultät, insbesondere aus dem Bereich der Grundlagenforschung oder der Onkologie, einen Bedarf an der Analyse ihrer molekularbiologischen Daten haben, der durch bestehenden Einrichtungen – wie z.B. Biometrie oder Humangenetik – (noch?) nicht gedeckt wird.
Es gibt erste vereinzelt Kooperationen oder durch Projektgelder finanzierte Gehversuche, translationale Forschungsplattformen wie z.B. tranSMART oder cBioPortal zu etablieren, aber dies ist keinesfalls ausreichend.
Ziele dieser Arbeit:
- Bedarfsanalyse: Übersicht benötigter (und auch bereits angebotener!) bioinformatischer Analysen.
- Machbarkeitsanalyse: Skizze, wie eine entsprechende Core-Unit eingerichtet werden könnte, sofern es einen tatsächlich noch nicht gedeckten Bedarf gibt.
Aufgaben / Fragestellungen:
- Welche Einrichtungen am UKER/MedFak haben einen bislang ungedeckten Bedarf an molekularbiologischen / bioinformatischen Analysen (Startpunkt: Forschungsbericht)?
- Wieviel wäre diesen die jeweilige Analyse finanziell wert?
- Welche Einrichtungen bieten eventuell solche Analysen in welchem Umfang/Konditionen bereits an?
- Sollte eine Unterdeckung bestehen:
- Welche erfolgreichen Beispiele gibt es an anderen Standorten (z.B. München)?
- Wie könnte eine entsprechende Core-Unit „auf die Schiene gesetzt“ werden?
- Welche Ausstattung würde benötigt?
Anforderungen / Voraussetzungen:
- Mindestens Grundkenntnisse der (Molekular-)Biologie hilfreich oder hohe Motivation zur Einarbeitung in diese Thematik nötig.
- Wirtschaftlicher Hintergrund hilfreich.
- Talent im bzw. offener Umgang mit Menschen: es werden reichlich Interviews nötig sein
Einstimmende Lektüre:
- Christoph J, Knell C, Bosserhoff A, Naschberger E, Stürzl M, Rübner M, Seuss H, Ruh M, Prokosch HU, Sedlmayr B: Usability and Suitability of the omics-integrating analysis platform tranSMART for Translational Research and Education. Applied Clinical Informatics. 2017;8(4):1173-1183. DOI: 4338/ACI-2017-05-RA-0085
- Singer, Jochen, et al. „Bioinformatics for precision oncology.“ Briefings in bioinformatics(2017).