Usability-Analyse der translationalen Forschungsplattform cBioPortal
Kontakt: M.Sc., M.Sc. Jan Christoph | jan.christoph@fau.de | 0179/9498865
Vergabe einer Masterarbeit (Informatik/MPM)
2018-03-21_Masterarbeit-Ausschreibung_MPM-Informatik_tranSMART-cBioPortal-Usability
Hintergrund / Problemstellung:
Im Rahmen des großen MIRACUM-Projekts mit acht bis 10 beteiligten Universitätsklinika ist die Forschungsplattform cBioPortal für den Einsatz im Anwendungsfall Molekulares Tumorboard vorgesehen. Dabei soll sie den Forscher/Kliniker in der Analyse des Tumors und der Erstellung einer Therapieempfehlung für den Patienten unterstützten. Während für die verwandte Plattform tranSMART am hiesigen Lehrstuhl bereits eine Usability-Analyse durchgeführt wurde [1], fehlt dies bislang für cBioPortal.
Ziele dieser Arbeit:
- Analyse der Usability von cBioPortal inkl. daraus abgeleiteter Empfehlungen zur Verbesserung
- Kongresspublikation darüber, z.B. in Studies in Health Technology and Informatics
Aufgaben / Fragestellungen:
- Wer sind die späteren Nutzer von cBioPortal im MIRACUM-Projekt?
- Welche Anwendungsfälle/Fragestellungen haben diese an cBioPortal?
- Wie (gut) können sie diese mit cBioPortal lösen?
- Usability-Evaluation
- Heuristische Evaluation
- Thinking Aloud Test
- System Usability Scale
- Wie kann die Usability von cBioPortal verbessert werden?
Zeitrahmen:
- Beginn baldmöglichst, ideal wäre Sommersemester 2018
Anforderungen / Voraussetzungen:
- Grundkenntnisse der (Molekular-)Biologie hilfreich
- innerdeutsche Reisebereitschaft an die anderen MIRACUM-Unikliniken
zur Vorort-Evaluation - Programmierkenntnisse nicht unbedingt nötig.
- Immer gut: hohe Motivation, selbstständige und strukturierte Arbeitsweise
- Studiengang: Informatik oder MPM
Einstimmende Lektüre:
- [1] Christoph J, Knell C, Bosserhoff A, Naschberger E, Stürzl M, Rübner M, Seuss H, Ruh M, Prokosch HU, Sedlmayr B: Usability and Suitability of the omics-integrating analysis platform tranSMART for Translational Research and Education. Applied Clinical Informatics. 2017;8(4):1173-1183. DOI: 4338/ACI-2017-05-RA-0085
- Singer, J., Irmisch, A., Ruscheweyh, H. J., Singer, F., Toussaint, N. C., Levesque, M. P., … & Beerenwinkel, N. (2017). Bioinformatics for precision oncology. Briefings in bioinformatics.